Pour répondre aux spécificités des activités de ses membres, la FNP a en son sein les sections suivantes :
– Section Armement de Fond : elle est composée de 60 navires glaciers, 100 navires congélateurs)
– Section Usines : qui regroupe 70 usines de traitement et de stockage (Nouadhibou et Nouakchott)
– Section Armement Pélagique : qui regroupe 50 navires Pélagiques
– Section Prestations de Service : composée de 45 prestataires de service
– Section Artisans de Pêche Zone Nord : composée de 2200 embarcations à Nouadhibou
– Section Artisans de Pêche Zone Sud : composée de 1500 embarcations à Nouakchott |